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實現R與Hadoop聯合作業的三種方法
2016-06-07
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實現R與Hadoop聯合作業的三種方法

為了滿足用R語言處理pb量級數據的需求,我們需要把它和Hadoop聯合起來使用。本文的目的就是闡述實現二者聯合作業的不同技術。

方法一:利用Streaming APIs

Hadoop支持一些 Streaming API來將R語言中的函數傳入,并在MapReduce模式下運行這些函數。這些Streaming API可以將任意能在map-reduce模式下訪問和操作標準I/O接口的R腳本傳入Hadoop中。因此,你不需要額外開啟一些客戶端之類的東西。如下是一個例子:



方法二:使用Rhipe包

Rhipe包允許用戶在R中使用MapReduce。在使用這一方法前,要做相應的前期準備工作。R需要被安裝在Hadoop集群中的每一個數據節點上,此外每個節點還要安裝Protocol Buffers(更多資料請參考 http://wiki.apache.org/hadoop/ProtocolBuffers),Rhipe也需要在每個節點上都可以被使用。

下面是在R中利用Rhipe應用MapReduce框架的范例:


方法三:使用RHadoop

RHadoop是Recolution Analytics下的一個開源庫,與Rhipe類似,它的功能也是在MapReduce模式下執行R函數。后續列舉的都是該庫中的一些包。plyrmr包可以在Hadoop中對大數據集進行一些常用的數據整理操作。rmr包提供了一些讓R和Hadoop聯合作業的函數。rdfs包提供了一些函數來連接R和分布式文件系統(HDFS)。rhbase包中的函數則能連接R和HBase。

下面這個例子中,我們會演示如何使用rmr包中的一些函數來讓R與Hadoop聯合作業。


方法總結

總的說來,上述三種方法都能很容易地實現R與Hadoop的聯合作業,這樣一來R就擁有了在分布式文件系統(HDFS)上處理大數據的能力。但同時,這三種方法也各有利弊。

關鍵結論:

1、使用Streaming APIs最為簡單,它的安裝和設置都很方便。Rhipe和RHadoop都需要對R進行一些設置,并且也需要Hadoop集群上一些包的支持。但在執行函數方面,Streaming APIs 需要將函數依次map和reduce,而Rhipe和RHadoop允許開發者在R函數中定義并調用MapReduce函數。

2、與Rhipe和RHadoop不同,使用Streamings APIs也不需要客戶端。

3、除此之外,我們也可以使用Apache Mahout,Apache Hive,Segue框架與其他來自Revolution Analytics的商業版R來實現大規模機器學習。

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