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Python機器學習算法之k均值聚類(k-means)
2018-05-23
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Python機器學習算法之k均值聚類(k-means)

一開始的目的是學習十大挖掘算法(機器學習算法),并用編碼實現一遍,但越往后學習,越往后實現編碼,越發現自己的編碼水平低下,學習能力低。這一個k-means算法用Python實現竟用了三天時間,可見編碼水平之低,而且在編碼的過程中看了別人的編碼,才發現自己對numpy認識和運用的不足,在自己的代碼中有很多可以優化的地方,比如求均值的地方可以用mean直接對數組求均值,再比如去最小值的下標,我用的是argsort排序再取列表第一個,但是有argmin可以直接用啊。下面的代碼中這些可以優化的并沒有改,這么做的原因是希望做到拋磚引玉,歡迎大家丟玉,如果能給出優化方法就更好了

一.k-means算法

人以類聚,物以群分,k-means聚類算法就是體現。數學公式不要,直接用白話描述的步驟就是:

1.隨機選取k個質心(k值取決于你想聚成幾類)
2.計算樣本到質心的距離,距離質心距離近的歸為一類,分為k類
3.求出分類后的每類的新質心
4.判斷新舊質心是否相同,如果相同就代表已經聚類成功,如果沒有就循環2-3直到相同

用程序的語言描述就是:

1.輸入樣本
2.隨機去k個質心
3.重復下面過程知道算法收斂:

計算樣本到質心距離(歐幾里得距離)
樣本距離哪個質心近,就記為那一類
計算每個類別的新質心(平均值)

二.需求分析

數據來源:從國際統計局down的數據,數據為城鄉居民家庭人均收入及恩格爾系數(點擊這里下載)

數據描述:

1.橫軸:城鎮居民家庭人均可支配收入和農村居民家庭人均純收入,
2.縱軸:1996-2012年。
3.數據為年度數據

需求說明:我想把這數據做個聚類分析,看人民的收入大概經歷幾個階段(感覺我好高大上?。?

需求分析

1.由于樣本數據有限,就兩列,用k-means聚類有很大的準確性
2.用文本的形式導入數據,結果輸出聚類后的質心,這樣就能看出人民的收入經歷了哪幾個階段

三.Python實現

引入numpy模塊,借用其中的一些方法進行數據處理,上代碼:


# -*- coding=utf-8 -*-
 
"""
authon:xuwf
created:2017-02-07
purpose:實現k-means算法
"""
 
importnumpy as np
importrandom
 
'''裝載數據'''
defload():
 data=np.loadtxt('data\k-means.csv',delimiter=',')
 returndata
 
'''計算距離'''
defcalcDis(data,clu,k):
 clalist=[]#存放計算距離后的list
 data=data.tolist()#轉化為列表
 clu=clu.tolist()
 foriinrange(len(data)):
  clalist.append([])
  forjinrange(k):
   dist=round(((data[i][1]-clu[j][0])**2+(data[i][2]-clu[j][1])**2)*0.05,1)
   clalist[i].append(dist)
 clalist=np.array(clalist)#轉化為數組
 returnclalist
 
'''分組'''
defgroup(data,clalist,k):
 grouplist=[]#存放分組后的集群
 claList=clalist.tolist()
 data=data.tolist()
 foriinrange(k):
  #確定要分組的個數,以空列表的形式,方便下面進行數據的插入
  grouplist.append([])
 forjinrange(len(clalist)):
  sortNum=np.argsort(clalist[j])
  grouplist[sortNum[0]].append(data[j][1:])
 grouplist=np.array(grouplist)
 returngrouplist
 
'''計算質心'''
defcalcCen(data,grouplist,k):
 clunew=[]
 data=data.tolist()
 grouplist=grouplist.tolist()
 templist=[]
 #templist=np.array(templist)
 foriinrange(k):
  #計算每個組的新質心
  sumx=0
  sumy=0
  forjinrange(len(grouplist[i])):
   sumx+=grouplist[i][j][0]
   sumy+=grouplist[i][j][1]
  clunew.append([round(sumx/len(grouplist[i]),1),round(sumy/len(grouplist[i]),1)])
 clunew=np.array(clunew)
 #clunew=np.mean(grouplist,axis=1)
 returnclunew
 
'''優化質心'''
defclassify(data,clu,k):
 clalist=calcDis(data,clu,k)#計算樣本到質心的距離
 grouplist=group(data,clalist,k)#分組
 foriinrange(k):
  #替換空值
  ifgrouplist[i]==[]:
   grouplist[i]=[4838.9,1926.1]
 clunew=calcCen(data,grouplist,k)
 sse=clunew-clu
 #print "the clu is :%r\nthe group is :%r\nthe clunew is :%r\nthe sse is :%r" %(clu,grouplist,clunew,sse)
 returnsse,clunew,data,k
 
if__name__=='__main__':
 k=3#給出要分類的個數的k值
 data=load()#裝載數據
 clu=random.sample(data[:,1:].tolist(),k)#隨機取質心
 clu=np.array(clu)
 sse,clunew,data,k=classify(data,clu,k)
 whilenp.any(sse!=0):
  sse,clunew,data,k=classify(data,clunew,k)
 clunew=np.sort(clunew,axis=0)
 print"the best cluster is %r"%clunew

四.測試

直接運行程序就可以,k值可以自己設置,會發現k=3的時候結果數據是最穩定的,這里我就不貼圖了
需要注意的是上面的代碼里面主函數里的數據結構都是array,但是在每個小函數里就有可能轉化成了list,主要原因是需要進行array的一下方法進行計算,而轉化為list的原因是需要向數組中插入數據,但是array做不到?。ㄖ辽傥覜]找到怎么做)。于是這里就出現了一個問題,那就是數據結構混亂,到最后我調試了半天,干脆將主函數的數據結構都轉化成array,在小函數中輸入的array,輸出的時候也轉化成了array,這樣就清晰多了

五.算法分析

單看這個算法還是較好理解的,但是算法的目的是聚類,那就要考慮到聚類的準確性,這里聚類的準確性取決于k值、初始質心和距離的計算方式。

k值就要看個人經驗和多次試驗了,算法結果在哪個k值的時候更穩定就證明這個分類更加具有可信度,其中算法結果的穩定也取決于初始質心的選擇

初始質心一般都是隨機選取的,怎么更準確的選擇初始質心呢?有種較難實現的方法是將樣本中所有點組合起來都取一遍,然后計算算法收斂后的所有質心到樣本的距離之和,哪個距離最小,哪個的聚類就最為成功,相對應的初始質心就選取的最為準確。但是這種方法有很大的計算量,如果樣本很大,維度很多,那就是讓電腦干到死的節奏

距離的計算方式取決于樣本的特征,有很多的選擇,入歐式距離,夾角余弦距離,曼哈頓距離等,具體的數據特性用具體的距離計算方式

六.項目評測

1.項目總結數據源的數據很干凈,不需要進行過多的數據清洗和數據降噪,數據預處理的工作成本接近為0。需求基本實現
2.還能做什么:可以用計算最小距離之和的方法求出最佳k值,這樣就可以得到穩定的收入階梯;可以引入畫圖模塊,將數據結果進行數據可視化,顯得更加直觀;如果可能應該引入更多的維度或更多的數據,這樣得到的聚類才更有說服力。

以上就是本文的全部內容,希望對大家的學習有所幫助



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