
數據分析之獨立樣本的T-Test分析
比較兩個獨立樣本數據之間是否有顯著性差異,將實驗數據與標準數據對比,查看
實驗結果是否符合預期。T-Test在生物數據分析,實驗數據效果驗證中很常見的數
據處理方法。- T-table查找表
獨立樣本T-test條件:
1. 每個樣本相互獨立沒有影響
2. 樣本大致符合正態分布曲線
3. 具有同方差異性
單側檢驗(one-tail Test)與雙側檢驗(Two-Tail Test)
基本步驟:
1.雙側檢驗, 條件聲明 alpha值設置為0.05
根據t-table, alpha = 0.05, df = 38時, 對于t-table的值為2.0244
2. 計算自由度(Degree of Freedom)
Df = (樣本1的總數 + 樣本2的總數)- 2
3. 聲明決策規則
如果計算出來的結果t-value的結果大于2.0244或者小于-2.0244則拒絕
4. 計算T-test統計值
5. 得出結論
如果計算結果在雙側區間之內,說明兩組樣本之間沒有顯著差異。
可重復樣本的T-Test計算
同樣一組數據在不同的條件下得到結果進行比對,發現是否有顯著性差異,最常見
的對一個人在飲酒與不飲酒條件下駕駛車輛測試,很容易得出酒精對駕駛員有顯著
影響
算法實現:
對獨立樣本的T-Test計算最重要的是計算各自的方差與自由度df1與df2
對可重復樣本的對比t-test計算
程序實現:
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package com.gloomyfish.data.mining.analysis;
public class TTestAnalysisAlg {
private double alpahValue = 0.05; // default
private boolean dependency = false; // default
public TTestAnalysisAlg() {
System.out.println("t-test algorithm");
}
public double getAlpahValue() {
return alpahValue;
}
public void setAlpahValue(double alpahValue) {
this.alpahValue = alpahValue;
}
public boolean isDependency() {
return dependency;
}
public void setDependency(boolean dependency) {
this.dependency = dependency;
}
public double analysis(double[] data1, double[] data2) {
double tValue = 0;
if (dependency) {
// Repeated Measures T-test.
// Uses the same sample of subjects measured on two different
// occasions
double diffSum = 0.0;
double diffMean = 0.0;
int size = Math.min(data1.length, data2.length);
double[] diff = new double[size];
for(int i=0; i
{
diff[i] = data2[i] -data1[i];
diffSum += data2[i] -data1[i];
}
diffMean = diffSum / size;
diffSum = 0.0;
for(int i=0; i
{
diffSum += Math.pow((diff[i] -diffMean), 2);
}
double diffSD = Math.sqrt(diffSum / (size - 1.0));
double diffSE = diffSD / Math.sqrt(size);
tValue = diffMean / diffSE;
} else {
double means1 = 0;
double means2 = 0;
double sum1 = 0;
double sum2 = 0;
// calcuate means
for (int i = 0; i < data1.length; i++) {
sum1 += data1[i];
}
for (int i = 0; i < data2.length; i++) {
sum2 += data2[i];
}
means1 = sum1 / data1.length;
means2 = sum2 / data2.length;
// calculate SD (Standard Deviation)
sum1 = 0.0;
sum2 = 0.0;
for (int i = 0; i < data1.length; i++) {
sum1 += Math.pow((means1 - data1[i]), 2);
}
for (int i = 0; i < data2.length; i++) {
sum2 += Math.pow((means2 - data2[i]), 2);
}
double sd1 = Math.sqrt(sum1 / (data1.length - 1.0));
double sd2 = Math.sqrt(sum2 / (data2.length - 1.0));
// calculate SE (Standard Error)
double se1 = sd1 / Math.sqrt(data1.length);
double se2 = sd2 / Math.sqrt(data2.length);
System.out.println("Data Sample one - > Means :" + means1
+ " SD : " + sd1 + " SE : " + se1);
System.out.println("Data Sample two - > Means :" + means2
+ " SD : " + sd2 + " SE : " + se2);
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