
先回憶一下之前用到的例子。
將其輸入R語言中:
age <- c(25, 34, 59, 60, 20) #患者年齡
type <- c(1, 2, 2, 2, 1) #糖尿病類型
status <- c("poor", "improved", "excellent", "poor", "excellent") #病情
comorbidity<- c(TRUE, FALSE, FALSE, TRUE, FALSE) #出現并發癥
mydata <- data.frame(age, type, status, comorbidity) #將數據框命名為mydata
查看mydata:
mydata
## age type status comorbidity
## 1 25 1 poor TRUE
## 2 34 2 improved FALSE
## 3 59 2 excellent FALSE
## 4 60 2 poor TRUE
## 5 20 1 excellent FALSE
接下來我們就以mydata為例,介紹一下如何對數據框進行簡單的操作。
了解一個數據框
多重線性回歸,一般是指有多個自變量X,只有一個因變量Y。前面我們主要是以簡單線性回歸為例在介紹,兩者的差距主要在于自變量X的數量,在只有一個X時,就稱簡單線性回歸。
面對數據,第一步就是要了解它有多少條記錄(或多少個case/ observation ),有多少個變量(variable)、分別是哪些。
## 獲取數據框的維度(幾行、幾列)
dim(mydata)
[1] 5 4
## 查看數據框中的所有變量名(列名)
names(mydata)
[1] "age" "type" "status" "comorbidity"
## 查看數據框的整體結構(維度、變量名、數據類型、數據內容)
str(mydata)
'data.frame': 5 obs. of 4 variables:
$ age : num 25 34 59 60 20
$ type : num 1 2 2 2 1
$ status : Factor w/ 3 levels "excellent","improved",..: 3 2 1 3 1
$ comorbidity: logi TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE
如何提取數據框中的行和列
多重線性回歸,一般是指有多個自變量X,只有一個因變量Y。前面我們主要是以簡單線性回歸為例在介紹,兩者的差距主要在于自變量X的數量,在只有一個X時,就稱簡單線性回歸。
2種方法:
1. 數據框后加[ , ]。逗號前是行,逗號后是列。如果沒有指定是哪一行或哪一列,默認為所有行/列。
## 提取第一行
mydata[1,]
age type status comorbidity
1 25 1 poor TRUE
## 提取第一列
mydata[,1]
[1] 25 34 59 60 2
## 提取某幾行或某幾列
## 提取1~3行
mydata[1:3,]
age type status comorbidity
1 25 1 poor TRUE
2 34 2 improved FALSE
3 59 2 excellent FALSE
## 提取第1和第5行的1、2、4列
mydata[c(1,5),c(1,2,4)]
age type comorbidity
1 25 1 TRUE
5 20 1 FALSE
## 變量很多時,用列名來提取更方便
mydata[c(1,5),c('age','type','comorbidity')]
age type comorbidity
1 25 1 TRUE
5 20 1 FALSE
2. 另一種提取列的方法是,在數據框后加 $,然后再加要提取的列名。
## 提取age這一列
mydata$age
[1] 25 34 59 60 20
獲取滿足特定條件的數據
多重線性回歸,一般是指有多個自變量X,只有一個因變量Y。前面我們主要是以簡單線性回歸為例在介紹,兩者的差距主要在于自變量X的數量,在只有一個X時,就稱簡單線性回歸。
1.提取滿足某一個條件的數據。
例如,在病情status這個變量中,有poor, improved 和 excellent這三類,現在想獲取病情最穩定、恢復最好的患者信息。也就是說,我們希望獲得status為excellent的病例,即選擇滿足mydata$status=='excellent'的行,以及被選中的行的每一列。
mydata[mydata$status=='excellent',]
age type status comorbidity
3 59 2 excellent FALSE
5 20 1 excellent FALSE
此外,還可進一步提取,例如,想獲得病情status為excellent的患者中,并發癥comorbidity的情況。換句話說,就是,想提取comorbidity的信息,但這些信息必須是病情最穩定的幾位患者的。
## 具體操作如下:先提取comorbidity,再設置status的條件
輸入語句:mydata$comorbidity[mydata$status=='excellent']
[1] FALSE FALSE
2.提取滿足多個條件的數據。
例如,想提取年齡age大于等于20歲,且小于35歲的病例。在R中,用&這個符號表達『并且』。用一個小豎杠 | 表達『或者』。
mydata[mydata$age>=20 & mydata$age<35,]
age type status comorbidity
1 25 1 poor TRUE
2 34 2 improved FALSE
5 20 1 excellent FALSE
3.subset()函數,既可用來選擇行,也可選擇列,當然也可以用來提取滿足特定條件的內容。
# 選擇行/滿足特定條件的行
subset(mydata, mydata$age>=20 & mydata$age<35)
age type status comorbidity
1 25 1 poor TRUE
2 34 2 improved FALSE
5 20 1 excellent FALSE
# 選擇列
subset(mydata, select = c('age','status'))
age status
1 25 poor
2 34 improved
3 59 excellent
4 60 poor
5 20 excellent
有缺失數據怎么辦
多重線性回歸,一般是指有多個自變量X,只有一個因變量Y。前面我們主要是以簡單線性回歸為例在介紹,兩者的差距主要在于自變量X的數量,在只有一個X時,就稱簡單線性回歸。
由于原來的數據框中沒有缺失數據,這里我們來構造一個新的記錄(observation),讓這個記錄中全部都是缺失值。
mydata[6,] <- NA
mydata
age type status comorbidity
1 25 1 poor TRUE
2 34 2 improved FALSE
3 59 2 excellent FALSE
4 60 2 poor TRUE
5 20 1 excellent FALSE
6 <NA> <NA> <NA> <NA>
1. 只保留無缺失的observations。如果希望將無缺失版本的數據框保存起來,要記得把na.omit(mydata)的結果賦值給新的對象。
mydata_no_NA <- na.omit(mydata)
mydata_no_NA
age type status comorbidity
1 25 1 poor TRUE
2 34 2 improved FALSE
3 59 2 excellent FALSE
4 60 2 poor TRUE
5 20 1 excellent FALSE
2. 查看哪個數據為缺失值。需要用到2個函數,這里提醒大家,如果R的語句太復雜,那么可以先從最中心的部分讀起,一層括號一層括號地向外擴展。
例如,下面的語句,可以先看最中間的is.na(mydata$age),意思是對age這列中的每個數據進行一次檢驗,返回『是否為缺失值』的邏輯型結果,即TRUE 或者 FALSE。再看which()這個函數,它返回的是前面這一串TRUE和FALSE中,出現TRUE的順序號。
從下面的結果我們可以看到,只有第6個數據是TRUE。
which(is.na(mydata$age))
[1] 6
is.na(mydata$age)
[1] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE
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